在最新一期《Current Biology》（當代生物學）中指出，原來椰子油是在眾多油的種類中，是最不環保的油，甚至嚴重影響生態。由於椰子主要於熱帶地區或太平洋小島種植，但會砍伐樹木，破壞雨林來建造椰子園，從而破壞動植物的棲息地，更加會危害生態。畢竟雨林內有很多瀕危動物，但由於需求過大，自然要種植更多椰子，變相傷害愈多。

而且文章指出，每百萬噸椰子油威脅到的生物物種達到20種，比棕櫚油更多。而早已有研究指出，植種椰子已導致了幾種物種的消失，包括塞舌爾繡眼鳥（Marianne white-eye）和所羅門群島的其中一種名為Ontong Java flying fox的蝙蝠。

雖然有不少研究指出椰子油會傷害生態，但是否代表要完全拒絕椰子油？其實在種植其他油的原料時，例如棕櫚、植物油時，同樣被指破壞環境，所以不是說要完全拒用，只是在使用時，不如從另一個角度想想背後的環境問題。